Para garantizar su trabajo la RAS-HON, funciona a través de los siguientes órganos

• Asamblea General, constituida por todos los Miembros a través de su representante o su respectivo suplente.

• Consejo Directivo, integrado por once instituciones: cuatro instituciones representantes del Sector Publico, cuatro representantes del Sector Civil y tres de las agencias de Cooperación, electas por cada uno de estos sectores.

• Comité Ejecutivo, actúa en representación de la Asamblea General y Consejo Directivo. Estará conformado por un miembro de los tres sectores representados.

• Secretaría Ejecutiva, será el órgano técnico ejecutor de las políticas y estrategias de la RAS-HON.

• Comisiones Especiales, como órganos auxiliares, el Consejo Directivo a solicitud de la Secretaría Técnica nombrar? las Comisiones Especiales que estime conveniente, con atribuciones específicas, los que serán regulados por los reglamentos que al efecto se emitan.